С помощью трехмерной нелинейной нестационарной математической модели распространения и трансформации примесей исследовалось вертикальное распределение соединений серы и азота в пограничном слое атмосферы Южного Прибайкалья. Численные эксперименты проводились при типичных метеорологических ситуациях. Выявлено существенное воздействие орографических неоднородностей на распространение примесей в регионе озера Байкал.